Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NeblQ0II04 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms