Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pate4Q09098 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms