Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MestQ07646 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MestQ07646 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MestQ07646 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MestQ07646 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MestQ07646 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MestQ07646 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MestQ07646 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MestQ07646 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MestQ07646 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MestQ07646 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MestQ07646 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MestQ07646 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MestQ07646 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MestQ07646 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MestQ07646 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MestQ07646 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MestQ07646 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MestQ07646 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MestQ07646 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MestQ07646 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MestQ07646 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MestQ07646 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MestQ07646 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MestQ07646 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MestQ07646 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MestQ07646 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MestQ07646 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MestQ07646 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MestQ07646 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MestQ07646 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MestQ07646 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MestQ07646 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MestQ07646 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MestQ07646 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MestQ07646 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MestQ07646 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MestQ07646 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MestQ07646 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MestQ07646 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms