Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sdr16c6Q05A13 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sdr16c6Q05A13 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms