Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bop1P97452 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bop1P97452 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Bop1P97452 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bop1P97452 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bop1P97452 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms