Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxd13P70217 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms