Protein–RNA interactions for Protein: P41139

Id4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Id4P41139 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Id4P41139 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Id4P41139 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Id4P41139 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Id4P41139 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Id4P41139 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Id4P41139 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Id4P41139 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Id4P41139 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Id4P41139 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Id4P41139 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Id4P41139 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Id4P41139 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Id4P41139 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Id4P41139 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Id4P41139 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Id4P41139 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Id4P41139 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Id4P41139 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Id4P41139 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Id4P41139 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Id4P41139 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Id4P41139 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Id4P41139 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Id4P41139 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Id4P41139 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Id4P41139 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Id4P41139 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Id4P41139 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Id4P41139 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Id4P41139 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Id4P41139 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Id4P41139 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Id4P41139 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Id4P41139 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Id4P41139 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Id4P41139 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Id4P41139 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Id4P41139 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms