Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpardP35396 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpardP35396 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpardP35396 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpardP35396 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpardP35396 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpardP35396 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpardP35396 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpardP35396 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpardP35396 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpardP35396 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpardP35396 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpardP35396 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpardP35396 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpardP35396 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpardP35396 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpardP35396 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpardP35396 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpardP35396 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpardP35396 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpardP35396 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpardP35396 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpardP35396 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpardP35396 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpardP35396 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PpardP35396 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PpardP35396 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PpardP35396 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PpardP35396 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpardP35396 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpardP35396 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpardP35396 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PpardP35396 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpardP35396 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpardP35396 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpardP35396 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpardP35396 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpardP35396 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpardP35396 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpardP35396 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpardP35396 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpardP35396 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PpardP35396 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpardP35396 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpardP35396 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpardP35396 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpardP35396 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpardP35396 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms