Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sftpa1P35242 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms