Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn11P35235 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms