Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms