Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RxrgP28705 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxrgP28705 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxrgP28705 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxrgP28705 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxrgP28705 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxrgP28705 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxrgP28705 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxrgP28705 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RxrgP28705 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RxrgP28705 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxrgP28705 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxrgP28705 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxrgP28705 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxrgP28705 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxrgP28705 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms