Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tpm3P21107 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3P21107 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms