Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtpraP18052 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpraP18052 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpraP18052 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpraP18052 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpraP18052 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpraP18052 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpraP18052 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpraP18052 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtpraP18052 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtpraP18052 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpraP18052 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtpraP18052 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpraP18052 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtpraP18052 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtpraP18052 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms