Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrm1P12657 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrm1P12657 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chrm1P12657 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms