Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxb3P09026 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb3P09026 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb3P09026 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms