Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01746 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01746 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01746 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01746 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01746 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01746 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01746 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01746 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01746 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01746 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01746 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01746 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01746 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01746 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01746 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01746 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01746 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01746 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01746 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01746 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01746 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01746 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01746 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01746 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01746 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01746 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01746 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01746 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms