Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

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Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StrnO55106 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
StrnO55106 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StrnO55106 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StrnO55106 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
StrnO55106 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StrnO55106 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StrnO55106 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
StrnO55106 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StrnO55106 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StrnO55106 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StrnO55106 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
StrnO55106 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StrnO55106 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StrnO55106 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
StrnO55106 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StrnO55106 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
StrnO55106 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
StrnO55106 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StrnO55106 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StrnO55106 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
StrnO55106 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StrnO55106 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StrnO55106 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StrnO55106 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StrnO55106 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StrnO55106 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StrnO55106 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StrnO55106 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StrnO55106 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
StrnO55106 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
StrnO55106 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StrnO55106 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StrnO55106 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StrnO55106 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
StrnO55106 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StrnO55106 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
StrnO55106 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StrnO55106 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StrnO55106 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
StrnO55106 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StrnO55106 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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StrnO55106 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StrnO55106 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StrnO55106 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StrnO55106 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StrnO55106 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StrnO55106 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
StrnO55106 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StrnO55106 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StrnO55106 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StrnO55106 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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StrnO55106 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StrnO55106 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StrnO55106 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StrnO55106 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StrnO55106 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
StrnO55106 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StrnO55106 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StrnO55106 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
StrnO55106 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StrnO55106 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
StrnO55106 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StrnO55106 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StrnO55106 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
StrnO55106 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms