Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2f6O54917 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2f6O54917 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2f6O54917 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2f6O54917 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2f6O54917 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2f6O54917 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2f6O54917 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2f6O54917 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms