Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chil3O35744 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chil3O35744 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chil3O35744 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chil3O35744 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms