Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smad7O35253 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Smad7O35253 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad7O35253 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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