Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NsmafO35242 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NsmafO35242 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NsmafO35242 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NsmafO35242 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NsmafO35242 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NsmafO35242 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmafO35242 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmafO35242 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmafO35242 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NsmafO35242 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NsmafO35242 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms