Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgisO35074 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtgisO35074 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtgisO35074 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtgisO35074 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtgisO35074 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgisO35074 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtgisO35074 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgisO35074 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgisO35074 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtgisO35074 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgisO35074 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgisO35074 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtgisO35074 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgisO35074 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtgisO35074 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PtgisO35074 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgisO35074 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtgisO35074 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtgisO35074 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtgisO35074 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtgisO35074 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtgisO35074 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtgisO35074 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtgisO35074 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtgisO35074 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgisO35074 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgisO35074 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgisO35074 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgisO35074 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgisO35074 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgisO35074 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgisO35074 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgisO35074 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtgisO35074 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtgisO35074 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms