Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Gm21976J3QNN2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm21976J3QNN2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Gm21976J3QNN2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm21976J3QNN2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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