Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bbip1J3QMK2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bbip1J3QMK2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms