Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20828J3KMI7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20828J3KMI7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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