Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r194J3JS27 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms