Protein–RNA interactions for Protein: H3BJD6

Ppp1r9a, Protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 9A, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r9aH3BJD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r9aH3BJD6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r9aH3BJD6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r9aH3BJD6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms