Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5218F6YH22 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms