Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms