Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5M4

Zfr2, Zinc finger RNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfr2E9Q5M4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfr2E9Q5M4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfr2E9Q5M4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfr2E9Q5M4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms