Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b2E9Q3E1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms