Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm6685D3YYP3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6685D3YYP3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6685D3YYP3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms