Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp42B2RQC2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms