Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H60bB1B212 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H60bB1B212 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms