Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1M4

Rps6kb2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb2Q9Z1M4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6kb2Q9Z1M4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6kb2Q9Z1M4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6kb2Q9Z1M4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149 ms