Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms