Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry2Q9R194 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.9 ms