Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plod3Q9R0E1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms