Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itgb1bp2Q9R000 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itgb1bp2Q9R000 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms