Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SpastQ9QYY8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpastQ9QYY8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms