Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dkk3Q9QUN9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms