Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmgn5Q9JL35 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms