Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3glb1Q9JK48 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3glb1Q9JK48 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3glb1Q9JK48 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3glb1Q9JK48 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms