Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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