Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms