Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms