Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms