Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms