Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Irx6Q9ER75 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx6Q9ER75 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms